Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PplQ9R269 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PplQ9R269 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PplQ9R269 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PplQ9R269 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PplQ9R269 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PplQ9R269 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PplQ9R269 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PplQ9R269 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PplQ9R269 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PplQ9R269 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PplQ9R269 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PplQ9R269 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PplQ9R269 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PplQ9R269 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PplQ9R269 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PplQ9R269 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PplQ9R269 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PplQ9R269 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PplQ9R269 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms