Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TapbpQ9R233 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TapbpQ9R233 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TapbpQ9R233 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms