Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Hsf4Q9R0L1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Hsf4Q9R0L1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms