Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0K7

Atp2b2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b2Q9R0K7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Atp2b2Q9R0K7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Atp2b2Q9R0K7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Atp2b2Q9R0K7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Atp2b2Q9R0K7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms