Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp21Q9QZL6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp21Q9QZL6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp21Q9QZL6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp21Q9QZL6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp21Q9QZL6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Usp21Q9QZL6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Usp21Q9QZL6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms