Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cpsf3Q9QXK7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cpsf3Q9QXK7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cpsf3Q9QXK7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms