Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trpc5Q9QX29 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trpc5Q9QX29 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trpc5Q9QX29 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trpc5Q9QX29 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms