Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PolkQ9QUG2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PolkQ9QUG2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PolkQ9QUG2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms