Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc42ep4Q9JM96 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdc42ep4Q9JM96 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms