Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ldb3Q9JKS4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ldb3Q9JKS4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ldb3Q9JKS4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms