Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ybx3Q9JKB3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ybx3Q9JKB3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ybx3Q9JKB3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ybx3Q9JKB3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms