Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gfra4Q9JJT2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gfra4Q9JJT2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gfra4Q9JJT2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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