Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ercc6l2Q9JIM3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ercc6l2Q9JIM3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms