Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Rb1cc1Q9ESK9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Rb1cc1Q9ESK9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rb1cc1Q9ESK9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rb1cc1Q9ESK9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms