Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp29Q9ES63 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Usp29Q9ES63 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp29Q9ES63 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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