Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SelenofQ9ERR7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SelenofQ9ERR7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms