Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ7

Rims2, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims2Q9EQZ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rims2Q9EQZ7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rims2Q9EQZ7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rims2Q9EQZ7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rims2Q9EQZ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms