Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vmn1r44Q9EQ47 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vmn1r44Q9EQ47 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms