Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPC5

Rbp7, Retinoid-binding protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp7Q9EPC5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rbp7Q9EPC5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
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Rbp7Q9EPC5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
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Rbp7Q9EPC5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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Rbp7Q9EPC5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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Rbp7Q9EPC5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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Rbp7Q9EPC5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rbp7Q9EPC5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
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Rbp7Q9EPC5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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Rbp7Q9EPC5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rbp7Q9EPC5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms