Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Smg9Q9DB90 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Smg9Q9DB90 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
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