Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Smdt1Q9DB10 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Smdt1Q9DB10 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Smdt1Q9DB10 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms