Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA83

1700018B08Rik, RIKEN cDNA 1700018B08, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018B08RikQ9DA83 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
1700018B08RikQ9DA83 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
1700018B08RikQ9DA83 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
1700018B08RikQ9DA83 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms