Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Y7

1700025F22Rik, RIKEN cDNA 1700025F22, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700025F22RikQ9D9Y7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
1700025F22RikQ9D9Y7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
1700025F22RikQ9D9Y7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700025F22RikQ9D9Y7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700025F22RikQ9D9Y7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms