Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atg7Q9D906 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg7Q9D906 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Atg7Q9D906 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atg7Q9D906 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms