Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc94Q9D6J3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc94Q9D6J3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc94Q9D6J3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc94Q9D6J3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms