Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt34Q9D646 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt34Q9D646 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms