Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U8

Cnbd2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnbd2Q9D5U8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cnbd2Q9D5U8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnbd2Q9D5U8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnbd2Q9D5U8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms