Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4930578G10RikQ9D4Q4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms