Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Syce1Q9D495 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Syce1Q9D495 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Syce1Q9D495 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms