Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Necap2Q9D1J1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Necap2Q9D1J1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms