Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2cQ9D1C1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2cQ9D1C1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms