Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Syf2Q9D198 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Syf2Q9D198 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Syf2Q9D198 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms