Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tmem53Q9D0Z3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 244.3 ms