Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mdm1Q9D067 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mdm1Q9D067 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mdm1Q9D067 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mdm1Q9D067 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mdm1Q9D067 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mdm1Q9D067 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mdm1Q9D067 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mdm1Q9D067 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mdm1Q9D067 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mdm1Q9D067 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mdm1Q9D067 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mdm1Q9D067 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms