Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Xrcc3Q9CXE6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Xrcc3Q9CXE6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms