Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Sycp2Q9CUU3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Sycp2Q9CUU3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Sycp2Q9CUU3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
Sycp2Q9CUU3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Sycp2Q9CUU3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms