Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkiras2Q9CR56 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nkiras2Q9CR56 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms