Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic3Q9CQE7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic3Q9CQE7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms