Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Asf1aQ9CQE6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Asf1aQ9CQE6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms