Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Itgb3bpQ9CQ82 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms