Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Npm3Q9CPP0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Npm3Q9CPP0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms