Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bco2Q99NF1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bco2Q99NF1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bco2Q99NF1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms