Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KarsQ99MN1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KarsQ99MN1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KarsQ99MN1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms