Protein–RNA interactions for Protein: Q99MI1

Erc1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erc1Q99MI1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Erc1Q99MI1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Erc1Q99MI1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Erc1Q99MI1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Erc1Q99MI1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Erc1Q99MI1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Erc1Q99MI1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Erc1Q99MI1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Erc1Q99MI1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Erc1Q99MI1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Erc1Q99MI1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Erc1Q99MI1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Erc1Q99MI1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Erc1Q99MI1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms