Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt84Q99M73 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Krt84Q99M73 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt84Q99M73 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt84Q99M73 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt84Q99M73 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt84Q99M73 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt84Q99M73 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt84Q99M73 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt84Q99M73 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt84Q99M73 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms