Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RtcbQ99LF4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RtcbQ99LF4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RtcbQ99LF4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms