Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC74AQ96AQ1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC74AQ96AQ1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC74AQ96AQ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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