Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Usp3Q91W36 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Usp3Q91W36 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp3Q91W36 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp3Q91W36 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp3Q91W36 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp3Q91W36 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp3Q91W36 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp3Q91W36 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Usp3Q91W36 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms