Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU6

Dcaf11, DDB1- and CUL4-associated factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcaf11Q91VU6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dcaf11Q91VU6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Dcaf11Q91VU6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Dcaf11Q91VU6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms