Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx9Q91VH2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Snx9Q91VH2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Snx9Q91VH2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms